Nasljedni nedostatak antitrombina tipa 2, u literaturi generalno nazvan kao tip 2 nedostatka antitrombina III (AT3D2), je veliki faktor rizika za tromboembolijsku bolest. Uzrokovan je mutacijama SERPINC1 gena koji vodi ka produkciji disfunkcionalnog antitrombina III. NAsuprot tome, nasljedni nedostatak antitrombina III tip 1 je povezan sa kvantitativnim nedostatcima antitrombina III. AT3D2 se prijavljuje manje često od bolesti tipa 1 ali se čini da ima veću prevalencu u općoj populaciji. Ova očita kontradiktornost je objašnjena činjenicom da je AT3D2 manje trombogeničan od protivnika.