Kallmanov sindrom tip 2 (KS2) je tip urođenog hipogonadotropnog hipogonadizma sa anosmijom. Uzrokuje ga mutacija na FGFR1 genu i obično se manifestuje kasnim pubertetom i poremećajem mirisa. Urođeni defekti poput malformacija prstiju, agnezije zuba i rascjepa usne i nepca se mogu uočiti i olakšavaju potragu za genskim defektom u podlozi oboljenja. Većina pacijenata sa KS2 dobro reaguje na hormonalnu terapiju, razviju normalne spolne odlike i mnogi imaju i potomstvo.